Федеральное государственное бюджетное учреждение НАЦИОНАЛЬНЫЙ МЕДИЦИНСКИЙ ИССЛЕДОВАТЕЛЬСКИЙ ЦЕНТР КАРДИОЛОГИИ ИМЕНИ АКАДЕМИКА Е.И. ЧАЗОВА Министерства здравоохранения Российской Федерации
Лаборатория клеточной подвижности
Создана в 1996 году по инициативе академика Е.И. Чазова и академика В.А. Ткачука. Коллектив Лаборатории составили сотрудники Лаборатории молекулярной эндокринологии.
Основным направлением деятельности Лаборатории является исследование молекулярных механизмов регуляции двигательной и сократительной активности клеточных элементов сердечно-сосудистой системы (эндотелиальных и гладкомышечных клеток сосудов) и мышечных клеток сердца (кардиомиоцитов). Понимание работы этих механизмов в норме позволяет выявлять нарушения, возникающие в них при сердечно-сосудистых заболеваниях и диабете и идентифицировать молекулярные мишени, воздействие на которые способствует восстановлению нормальных клеточных функций. По такому алгоритму на базе фундаментальных исследований в Лаборатории ведется поиск новых лекарственных препаратов для защиты сердца и сосудов.
Дальнейшим развитием эндотелиального направления в Лаборатории стало исследование молекулярных механизмов формирования эндотелиальной дисфункции при метаболических и гемодинамических нарушениях с целью разработки эндотелиопротективных технологий для применения в кардиологии, эндокринологии и других областях медицины.
В Лаборатории используются высокотехнологичные клеточные модели на основе эндотелиальных клеток сосудов человека и кардиомиоцитов. Эти модели позволяют воспроизводить in vitro метаболические нарушения (дислипидемию, гипергликемию и др.), регулируемую гипоксию, нарушения гемодинамики и электростимуляции клеток и анализировать проницаемость эндотелиального барьера, сократимость кардиомиоцитов, синтез клетками оксида азота и активных форм кислорода, внутриклеточный транспорт ионов кальция и другие параметры с помощью флуоресцентных зондов и видеомикроскопии. Для целенаправленного воздействия на потенциальные молекулярные мишени в эндотелиальных клетках используются методы генной инженерии, РНК-интерференции, ингибиторно-активаторного анализа. С помощью лентивирусной трансдукции в клетках экспрессируются интересующие исследователя белковые молекулы, слитые с флуоресцентными белками, что позволяет наблюдать за их поведением под микроскопом при моделировании патологических условий клеточного окружения. Метод иммуноблоттинга применяется для оценки уровней активации/ ингибирования внутриклеточных белков с помощью фосфоспецифических антител. Поскольку сайт-специфическое фосфорилирование является природным способом изменения активности многих ключевых белковых регуляторов в эндотелии, кардиомиоцитах и других клетках, в Лаборатории с помощью биоинформатических подходов и генно-инженерных технологий создаются фосфоимитирующие и нефосфорилируемые формы таких белков, в частности, протеинкиназ. Видеомикроскопия и другие методы анализа клеток, экспрессирующих белки-фосфомутанты, помогают выявить регуляторное влияние фосфорилирования на клеточные функции и оценить перспективы фармакологического воздействия на этот процесс. Применяемые клеточные модели также используются при первичном скрининге новых соединений – кандидатов в лекарство.
В Лаборатории разрабатываются современные подходы к анализу сетевой организации сигнальных систем клетки, позволяющие использовать искусственный интеллект и машинное обучение для понимания их связи с метаболизмом и поиска перспективных терапевтических мишеней. В качестве таких мишеней рассматриваются регуляторы активностей ключевых белковых комплексов, контролирующих анаболизм (комплексы механистической мишени рапамицина, mTOR) и катаболизм (комплексы АМФ-зависимой протеинкиназы, АМPК).
Основные достижения Лаборатории
- В совместных исследованиях с коллегами из США была впервые описана высокомолекулярная L-изоформа киназы легких цепей миозина – важнейший регулятор подвижности немышечных клеток, в том числе, эндотелия кровеносных сосудов. При целом ряде патологических состояний и стресс-воздействий L-киназы легких цепей миозин активируется и запускает сокращение эндотелиальных клеток сосудов в составе монослоя, что коррелирует с нарушением барьерной функции эндотелия и развитием гиперпроницаемости микрососудов. Идентификация L-киназы легких цепей миозин как ключевого активатора сосудистой гиперпроницаемости позволила выбрать этот фермент в качестве молекулярной мишени и начать разработку новых эндотелиопротективных и противоотечных лекарственных препаратов для медицины неотложных состояний.
- Совместно с Лабораторией синтеза пептидов Институт экспериментальной кардиологии им. ак. В.Н. Смирнова создано семейство оригинальных проникающих в клетки пептидных ингибиторов киназы легких цепей миозина. Один из представителей этого семейства, ПИК7, в многоцентровых доклинических исследованиях продемонстрировал выраженное защитное действие на сосудистую стенку и подлежащие ткани при ишемии-реперфузии сердца, мозга, тонкого кишечника и почек за счет снижения их реперфузионного повреждения. В настоящее время ПИК7, первый в мире экспериментальный эндотелиопротективный препарат – прямой ингибитор киназы легких цепей миозина, проходит клинические исследования 1 фазы (переносимость и безопасность препарата у здоровых добровольцев). В дальнейшем планируется применение ПИК7 на стадии активного восстановления кровотока при остром инфаркте миокарда и ишемическом инсульте, а также для защиты органов при хирургических операциях с остановленным локальным кровотоком и при трансплантации органов, где планово выполняется восстановление кровотока в органе, и не исключено его реперфузионное повреждение.
- Исследуя совместно с немецкими учеными роль гладкомышечного белка KRP, который кодируется тем же геном, что и L-киназы легких цепей миозин, мы пришли к выводу, что KRP может выполнять функцию универсального ингибитора протеинкиназ, активирующих гладкомышечный миозин, таких как киназа легких цепей миозина, ROCK, DAPK и др. Это новый ранее не рассматривавшийся аспект регуляции сокращения гладких мышц. Возможно, аналогичную роль играет и KRP-домен L-киназа легких цепей миозина в немышечных клетках – эндотелии, эпителии, лейкоцитах.
- Выявлены молекулярные механизмы кооперации протеинкиназ L- киназы легких цепей миозина и ROCK в эндотелиальных клетках, приводящие к развитию стресс-индуцированной гиперпроницаемости эндотелия. Эти исследования обосновали комбинированный фармакологический подход к снижению гиперпроницаемости микрососудов и позволили начать экспериментальную проверку эффективных противоотечных лекарственных сочетаний, включающих ПИК7.
- При исследовании барьерных свойств эндотелиальных клеток в условиях метаболического моделирования различных этапов развития сахарного диабета 2 типа было установлено, что наибольший негативный эффект на эндотелиальный барьер оказывают продукты перекисного окисления липидов, такие как малоновый диальдегид, но не производные глюкозы глиоксаль и метилглиоксаль, несмотря на то, что эти дикарбонилы также модифицируют эндотелиальные белки. Полученные данные указывают на то, что обусловленное дислипидемией оксидативное повреждение сосудистой стенки при развитии диабета возникает раньше, чем в организме сформируется стойкая гипергликемия, что предполагает более ранние меры профилактики и лечения.
- Длительное (1 месяц) стационарное культивирование эндотелия в условиях гипергликемии не нарушает его жизнеспособности, барьерных свойств и реакции на агонисты (гистамин, тромбин), что согласуется с отсутствием влияния гликоальдегидов на эндотелиальный барьер. Объяснение причин развития сосудистых повреждений у больных сахарным диабетом 2 типа требует, таким образом, учета дополнительных факторов повреждения сосудов и может сопровождаться переосмыслением медикаментозной стратегии для этих больных.
- Установлено, что активатор АМФ-зависимой протеинкиназы AICAR (структурный аналог АМФ) повышает устойчивость эндотелиальных клеток к повреждающему действию свободных насыщенных жирных кислот, таких как пальмитат, уровень которого в крови возрастает при морбидном ожирении. Из двух изоформ каталитических субъединиц АМФ-зависимой протеинкиназы, присутствующих в эндотелии, защиту против избытка пальмитата обеспечивает ее альфа-1 изоформа. Значительно более мощную защиту от липотоксичности пальмитата обеспечивает напряжение сдвига на эндотелии, создаваемое потоком среды роста in vitro, моделирующим поток крови в сосудах. Защитный эффект напряжения сдвига не опосредуется эндотелиальной АМФ-зависимой протеинкиназы, хотя она и активируется в этих условиях.
- В совместных исследованиях с лабораторией экспериментальной патологии сердца и коллегами из Института молекулярной биологии РАН показан кардиопротективный эффект биоподобных синтетических комплексов глутатиона и оксида азота – динитрозильных комплексов железа с глутатионом и нитрозоглутатиона. В условиях глубокой гипоксии эти соединения пролонгировали сократительную активность кардиомиоцитов и изолированного сердца крысы за счет поддержания нормальных осцилляций ионов кальция в саркоплазме. На основе динитрозильных комплексов железа с глутатионом в ФГБУ «НМИЦК им. ак. Е.И. Чазова» Минздрава России создан гипотензивный препарат «Оксаком», подтвердивший свою эффективность при купировании гипертонических кризов у пациентов. Полученные нами данные свидетельствуют в пользу того, что «Оксаком» может также применяться для защиты ишемизированного миокарда при кардиохирургических операциях и у пациентов с хронической ишемической болезнью сердца. Совместно с профессором А.Ф. Ваниным (Институт химической физики им. Н.Н. Семенова РАН) на основе этилового эфира глутатиона создан новый вариант динитрозильных комплексов железа с глутатионом, обладающий более высокой кардиопротективной активностью, чем «Оксаком».
- Научные исследования Лаборатории поддержаны грантами Российского фонда фундаментальных исследований и грантами международных научных организаций (HHMI, Wellcome Trust, BHF, Fogarty, CRDF, DFG, INTAS). В настоящее время исследования выполняются в рамках Государственных заданий и грантов Российского научного фонда. Научно-технические разработки Лаборатории защищены 6 патентами Российской Федерации и Европейским патентом.
СПИСОК НАИБОЛЕЕ ЗНАЧИМЫХ ПУБЛИКАЦИЙ ЛАБОРАТОРИИ
- Watterson, D.M., Collinge, M., Lukas, T.J., Van Eldik, L.J., Birukov, K.G., Stepanova, O.V., Shirinsky, V.P. Multiple gene products are produced from a novel protein kinase transcription region. FEBS letters 1995, 373, 217-220, doi:10.1016/0014-5793(95)01048-j. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/7589469/
- Wainwright, M.S., Rossi, J., Schavocky, J., Crawford, S., Steinhorn, D., Velentza, A.V., Zasadzki, M., Shirinsky, V., Jia, Y., Haiech, J., et al. Protein kinase involved in lung injury susceptibility: evidence from enzyme isoform genetic knockout and in vivo inhibitor treatment. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 2003, 100, 6233-6238, doi:10.1073/pnas.1031595100. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/12730364/
- Kudryashov, D.S., Stepanova, O.V., Vilitkevich, E.L., Nikonenko, T.A., Nadezhdina, E.S., Shanina, N.A., Lukas, T.J., Van Eldik, L.J., Watterson, D.M., Shirinsky, V.P. Myosin light chain kinase (210 kDa) is a potential cytoskeleton integrator through its unique N-terminal domain. Experimental cell research 2004, 298, 407-417, doi:10.1016/j.yexcr.2004.04.025. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/15265689/
- Shcherbakova, O.V., Serebryanaya, D.V., Postnikov, A.B., Schroeter, M.M., Zittrich, S., Noegel, A.A., Shirinsky, V.P., Vorotnikov, A.V., Pfitzer, G. Kinase-related protein/telokin inhibits Ca2+-independent contraction in Triton-skinned guinea pig taenia coli. The Biochemical journal 2010, 429, 291-302, doi:10.1042/bj20090819. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/20459395/
- Khapchaev, A.Y., Kazakova, O.A., Samsonov, M.V., Sidorova, M.V., Bushuev, V.N., Vilitkevich, E.L., Az'muko, A.A., Molokoedov, A.S., Bespalova, Z.D., Shirinsky, V.P. Design of peptidase-resistant peptide inhibitors of myosin light chain kinase. Journal of peptide science : an official publication of the European Peptide Society 2016, 22, 673-681, doi:10.1002/psc.2928. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27699916/
- Khapchaev, A.Y., Shirinsky, V.P. Myosin Light Chain Kinase MYLK1: Anatomy, Interactions, Functions, and Regulation. Biochemistry. Biokhimiia 2016, 81, 1676-1697, doi:10.1134/s000629791613006x. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/28260490/
- Kapelko, V.I., Lakomkin, V.L., Abramov, A.A., Lukoshkova, E.V., Undrovinas, N.A., Khapchaev, A.Y., Shirinsky, V.P. Protective Effects of Dinitrosyl Iron Complexes under Oxidative Stress in the Heart. Oxidative medicine and cellular longevity 2017, 2017, 9456163, doi:10.1155/2017/9456163. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/28421129/
- Samsonov, M.V., Khapchaev, A.Y., Vorotnikov, A.V., Vlasik, T.N., Yanushevskaya, E.V., Sidorova, M.V., Efremov, E.E., Lankin, V.Z., Shirinsky, V.P. Impact of Atherosclerosis- and Diabetes-Related Dicarbonyls on Vascular Endothelial Permeability: A Comparative Assessment. Oxidative medicine and cellular longevity 2017, 2017, 1625130, doi:10.1155/2017/1625130. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/29098058/
- Poluektov, Y.M., Petrushanko, I.Y., Undrovinas, N.A., Lakunina, V.A., Khapchaev, A.Y., Kapelko, V.I., Abramov, A.A., Lakomkin, V.L., Novikov, M.S., Shirinsky, V.P., et al. Glutathione-related substances maintain cardiomyocyte contractile function in hypoxic conditions. Scientific reports 2019, 9, 4872, doi:10.1038/s41598-019-41266-2. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/30890744/
- Kazakova, O.A., Khapchaev, A.Y., Shirinsky, V.P. MLCK and ROCK mutualism in endothelial barrier dysfunction. Biochimie 2020, 168, 83-91, doi:10.1016/j.biochi.2019.10.010. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31668993/
- Khapchaev, A.Y., Watterson, D.M., Shirinsky, V.P. Phosphorylation-dependent subcellular redistribution of small myosin light chain kinase. Biochimica et biophysica acta. Molecular cell research 2021, 1868, 119104, doi:10.1016/j.bbamcr.2021.119104. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34302892/
- Samsonov, M.V., Podkuychenko, N.V., Khapchaev, A.Y., Efremov, E.E., Yanushevskaya, E.V., Vlasik, T.N., Lankin, V.Z., Stafeev, I.S., Skulachev, M.V., Shestakova, M.V., et al. AICAR Protects Vascular Endothelial Cells from Oxidative Injury Induced by the Long-Term Palmitate Excess. International journal of molecular sciences 2021, 23, doi:10.3390/ijms23010211. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35008640/
- Vorotnikov, A.V., Khapchaev, A.Y., Nickashin, A.V., Shirinsky, V.P. In Vitro Modeling of Diabetes Impact on Vascular Endothelium: Are Essentials Engaged to Tune Metabolism? Biomedicines 2022, 10, doi:10.3390/biomedicines10123181. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36551937/
- Khapchaev, A.Y., Antonova, O.A., Kazakova, O.A., Samsonov, M.V., Vorotnikov, A.V., Shirinsky, V.P. Long-Term Experimental Hyperglycemia Does Not Impair Macrovascular Endothelial Barrier Integrity and Function in vitro. Biochemistry. Biokhimiia 2023, 88, 1126-1138, doi:10.1134/s0006297923080072. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37758312/
- Khapchaev, A.Y., Vorotnikov, A.V., Antonova, O.A., Samsonov, M.V., Shestakova, E.A., Sklyanik, I.A., Tomilova, A.O., Shestakova, M.V., Shirinsky, V.P. Shear Stress and the AMP-Activated Protein Kinase Independently Protect the Vascular Endothelium from Palmitate Lipotoxicity. Biomedicines 2024, 12, doi:10.3390/biomedicines12020339. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38397940/
Руководитель Лаборатории клеточной подвижности – Ширинский Владимир Павлович, доктор биологических наук, профессор, главный научный сотрудник
Сотрудники Лаборатории
- Воротников Александр Вячеславович, ведущий научный сотрудник, кандидат биологических наук
- Хапчаев Аскер Юсуфович, старший научный сотрудник, кандидат биологических наук
- Дорощук Александр Дмитриевич, научный сотрудник, кандидат биологических наук
- Самсонов Михаил Васильевич, младший научный сотрудник
- Никашин Алексей Вячеславович, биолог
- Подкуйченко Никита Владимирович, лаборант-исследователь
- Орехова Анастасия Александровна, лаборант-исследователь
- Ундровинас Нидас Альберто, лаборант-исследователь
-
Контакты
Телефон: 8-495-414-72-46
Электронная почта: shirinsky@gmail.com